Hugo Spadafora nació en Chitré. Sus estudios secundarios los realiza en el Instituto Nacional, donde ocupa el tercer puesto de honor. Estudió Medicina en la Universidad de Bologna, Italia, donde se gradúa en noviembre de 1964.
En enero de 1965 regresa a Panamá y comienza a trabajar en el Hospital Santo Tomás, pero en agosto de ese mismo año parte hacia El Cairo a iniciar estudios adicionales.
En 1969 luchó contra el golpe militar del General Torrijos, pero luego se une al régimen.
Ocho días después de la victoria sandinista, regresó a Panamá, sólo para volver a Nicaragua tres años más tarde, en 1982, esta vez para luchar al lado de Pastora en contra de la Junta en el poder. Dos años después abandona a Pastora, y se suma al lado del líder indígena Brooklyn Rivera. En agosto de 1985, un mes antes de su asesinato, declara públicamente que regresa a Panamá a dedicarse a la política.
El viernes 13 de septiembre de 1985, el Dr. Hugo Spadafora Franco salió de su casa en San José, Costa Rica (donde vivía con su esposa de nacionalidad costarricense), con destino a la ciudad de Panamá, tomando la siguiente ruta o itinerario varias veces hecho: San José-Coto47 - Paso Canoas-David-Panamá; tomó un pequeño avión hasta Coto 47, localidad cercana a la frontera con Panamá; de allí tomó un taxi hasta Paso Canoas y almuerza en el restaurante "Los Mellos", en territorio panameño.
Abordó un autobús. En Concepción es bajado por un agente de las Fuerzas de Defensa en civil. Esta fue la última vez que el Dr. Hugo Spadafora Franco fue visto con vida, ya que en la mañana del sábado 14 de septiembre de 1985, su cuerpo fue hallado decapitado en la quebrada El Roblito, en territorio costarricense.