Según el último informe de monitoreo de la calidad del agua, los ríos Curundú, Matías Hernández, Mataznillo y Río Abajo son los que presentaron la contaminación más crítica.
Los ríos Juan Díaz, Tapia y Caimito presentan en su parte alta, aguas poco contaminadas.
Los ríos Pacora y Capira fueron los que presentaron la mejor calidad de agua de las cuencas evaluadas por la ANAM y JICA. El informe destaca que la contaminación proviene en muchos casos de excrementos humano, actividades industriales y agrícolas.
