La Alcaldía de Panamá será auditada por la Contraloría de Panamá, a solicitud del propio alcalde Juan Carlos Navarro.
Esta acción fiscalizadora abarcará todas las dependencias que integran el Municipio de Panamá, dentro del periodo comprendido entre el 1 de septiembre de 1999 y el 31 de agosto de 2004.
Una fuente de la Alcaldía dijo no saber cuándo iniciarían la auditoría, pero que esto es un requisito indispensable para iniciar el nuevo gobierno municipal. Anualmente la Contraloría realiza la inspección a las finanzas.