El rendimiento de los estanques productores de peces y camarones, generalmente está limitado por las bajas concentraciones de ciertos elementos nutritivos en el agua. Como regla general, los elementos nutritivos limitantes más importantes en los sistemas acuáticos son el fósforo y el nitrógeno (N y P).
En regiones con climas cálidos se quiere incrementar la productividad natural del agua de los estanques dedicados a producir peces por medio de la estimulación del crecimiento y desarrollo del fitoplancton, sustancia de la que se alimentan los peces en crecimiento. Se puede realizar esto estableciendo un programa para aplicar fertilizantes al agua del estanque.
Se utilizan varias clases de fertilizantes químicos (minerales) y orgánicos (principalmente estiércol) disponibles localmente para incrementar la fertilidad del agua, y fomentar una proliferación de algas y otros tipos de microorganismos en el estanque. Los fertilizantes escogidos deben proveer N y P en cantidades adecuadas.
Debido a la presencia de suelos arcillosos en los proyectos acuícolas, normalmente no es necesario fertilizar con potasio. Con una adecuada fertilización de los estanques se puede aumentar de 4 a 10, o más veces, la producción de peces y/o camarones.
