Por años, el problema de la contaminación del río Zaratí ha sido objeto de discusión de diferentes residentes, autoridades e investigadores particulares.
Salvar el río Zaratí, principal afluente en Penonomé, es una de las metas que se ha trazado la Fundación Eco aguas de Penonomé, que asegura que la contaminación y la tala indiscriminada son los causales del mal que aqueja este río por donde pasa la historia, el turismo y las leyendas regionalistas; un río que es utilizado para abastecer de agua potable a cerca de 22, 475 habitantes.
El río Zaratí abastece de agua a miles de campesinos a través de los acueductos rurales, además sirve para abastecer a la recién construida planta potabilizadora.